Der Kern von MOLGEN wurde in C/C++ programmiert, einer Sprache, die sich durch einen hohen Grad an Portabilität auszeichnet. Um diese Eigenschaft auch für die Benutzeroberfläche zu gewährleisten, wurde als Entwicklungswerkzeug die Klassenbibliothek StarView gewählt, mit deren Hilfe sich mit einem Code Versionen für verschiedene PC- und UNIX-Plattformen erstellen lassen. Dazu die Abbildungen des Hauptfensters auf verschiedenen Plattformen und der verschiedenen Eingabefenster für das Dioxin-Beispiel.
